42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3188 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  100 
 
 		 311 aa  648    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  94.21 
 
 		 311 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  64.86 
 
 		 313 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  53.07 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  54.05 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  54.05 
 
 		 311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  53.72 
 
 		 311 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  52.29 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  47.25 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  47.25 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.72 
 
 		 622 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 622 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  29.48 
 
 		 314 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  29.37 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  21.94 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  24.02 
 
 		 383 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  25.83 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  26.09 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.36 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.3 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  23.68 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  26.38 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  26.38 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.91 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  25.44 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.59 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  28.49 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  26.22 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.57 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.08 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  24.3 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  23.24 
 
 		 619 aa  55.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  20.98 
 
 		 413 aa  52.8  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  25.7 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  18.38 
 
 		 526 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.04 
 
 		 590 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  23.21 
 
 		 596 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46453  predicted protein  26.61 
 
 		 438 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  18.32 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  21.12 
 
 		 603 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>