46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3288 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  100 
 
 		 304 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  34.46 
 
 		 622 aa  188  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 622 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  31.7 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  31.15 
 
 		 522 aa  139  7.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  29.8 
 
 		 596 aa  122  7e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  30 
 
 		 611 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.23 
 
 		 592 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  26.72 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  27.24 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  24.63 
 
 		 619 aa  95.1  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 590 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  28.63 
 
 		 383 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.59 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  26.26 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  25.47 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  24.18 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.28 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  24.63 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  24.91 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  24.82 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  26.14 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  24.35 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  24.45 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  24.72 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  24.34 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  24.34 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.81 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  24.8 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  24.41 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  23.37 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  23.48 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  23.9 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  23.9 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  22.42 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  23.33 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  22.71 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  22.87 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  21.8 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  24.37 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  22.98 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  23.88 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  28 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2750  aminoglycoside phosphotransferase  23.46 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000713701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>