47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0106 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  98.73 
 
 
314 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
314 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  55.66 
 
 
311 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  55.66 
 
 
311 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  55.34 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  53.72 
 
 
307 aa  315  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  49.84 
 
 
311 aa  297  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  47.9 
 
 
311 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  48.56 
 
 
313 aa  291  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  47.25 
 
 
311 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  31.3 
 
 
314 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  25.56 
 
 
622 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
622 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 
307 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  28.86 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.93 
 
 
383 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  29.89 
 
 
595 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.81 
 
 
383 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  27.52 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  29.58 
 
 
326 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  31.42 
 
 
305 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.64 
 
 
611 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  25.25 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.17 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  26.61 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  28.5 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  25.75 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  27.49 
 
 
619 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  26.59 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.63 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.94 
 
 
590 aa  73.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  26.07 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.13 
 
 
592 aa  67.4  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  27.27 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
596 aa  63.9  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  27.36 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.47 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  20.16 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.07 
 
 
603 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  21.37 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  20.08 
 
 
266 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  20.08 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  26.77 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  17.29 
 
 
526 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  22.86 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>