54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0797 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  100 
 
 		 324 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  40.16 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  28.22 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  25.65 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  25.32 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 622 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  26.71 
 
 		 622 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.72 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  28.36 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  26.35 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  26.35 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  26.01 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  23.99 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  24.09 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  26.1 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  24.83 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  24.11 
 
 		 383 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  24.11 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  23.55 
 
 		 522 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.12 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  26.24 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  22.67 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  19.63 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  23.58 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  27.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  24.32 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  27.27 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  27.27 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  27.27 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  26.57 
 
 		 274 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  21.66 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  21.63 
 
 		 592 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.37 
 
 		 611 aa  49.7  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.89 
 
 		 589 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  25.35 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  31.73 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  24.59 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  19.07 
 
 		 266 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  27.08 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  27.08 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  26.39 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  27.08 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0763  aminoglycoside phosphotransferase  26.17 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000554217 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  22.4 
 
 		 596 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  33.9 
 
 		 603 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  27.55 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>