27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3189 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  79.5 
 
 		 317 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  55.27 
 
 		 316 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  33.9 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  31.1 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  33.92 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  31.76 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  31.4 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  29.37 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  26.46 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  26.71 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  27 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  27 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  27 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.75 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.75 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  24.19 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  24.47 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  26.55 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  23.65 
 
 		 622 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 622 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  19.9 
 
 		 383 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  18.46 
 
 		 383 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  26.26 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  28.64 
 
 		 387 aa  42.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>