49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3750 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
311 aa  639    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  99.68 
 
 
311 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  98.39 
 
 
311 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  73.63 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  74.35 
 
 
307 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  54.05 
 
 
311 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  53.72 
 
 
311 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  55.66 
 
 
314 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  55.34 
 
 
314 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  52.75 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  32.5 
 
 
314 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  29.9 
 
 
307 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  32.5 
 
 
314 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  26.59 
 
 
622 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  28.37 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
622 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  27 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.37 
 
 
383 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  24.17 
 
 
317 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.37 
 
 
383 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  26.99 
 
 
326 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  26.6 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  30.32 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  26.92 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.34 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  25.95 
 
 
595 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.82 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  24.72 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.11 
 
 
589 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
596 aa  65.9  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.02 
 
 
592 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  25.1 
 
 
619 aa  63.9  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  29.82 
 
 
590 aa  63.5  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.44 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.29 
 
 
611 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.08 
 
 
421 aa  59.3  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  24.73 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  21.72 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.79 
 
 
603 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  29.83 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  26.85 
 
 
413 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  21.54 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  19.11 
 
 
526 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  28.93 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  27.86 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  21.62 
 
 
266 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01400  choline kinase, putative  27.67 
 
 
519 aa  42.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.918034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>