22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3055 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 317 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  79.5 
 
 		 317 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  59.65 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  33.45 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  30.93 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  33.1 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  31.23 
 
 		 326 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  29.18 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  27.14 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.52 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.52 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  25.83 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  24.17 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  24.17 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  24.72 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  23.84 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  24.86 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  23.74 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  21.97 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25 
 
 		 611 aa  43.5  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>