46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0045 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
313 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  65.06 
 
 
311 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  64.86 
 
 
311 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  53.07 
 
 
311 aa  322  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  53.07 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  52.75 
 
 
311 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  52.1 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  48.88 
 
 
311 aa  301  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  48.88 
 
 
314 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  48.56 
 
 
314 aa  291  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.33 
 
 
622 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
622 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 
307 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  31.58 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.8 
 
 
383 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  21.82 
 
 
383 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  28.46 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  22.98 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  28.62 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  29.37 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.62 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  26.26 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.08 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  23.29 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.57 
 
 
611 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  25.85 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.45 
 
 
522 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  26.57 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  22.11 
 
 
619 aa  56.6  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 
596 aa  56.2  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.39 
 
 
592 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.6 
 
 
589 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  25.19 
 
 
291 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  23.4 
 
 
595 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  22.26 
 
 
590 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  24.55 
 
 
413 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  20.16 
 
 
526 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  21.67 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  26.47 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  26.47 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  26.47 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  26.47 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>