36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1456 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  98.73 
 
 		 314 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  33.1 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  33.67 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  37.41 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  30.82 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  35.65 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  35.56 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  31.03 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  31.03 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  32 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  31.56 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  31.56 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  29.48 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  28.46 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  28.62 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  28.3 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  28.75 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  23.19 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  29.46 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  21.46 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  29.78 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  29.17 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  27.19 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  27.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  27.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  27.19 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  24.68 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  26.73 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  26.67 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2120  aminoglycoside phosphotransferase  48.65 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  26.32 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>