46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2590 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  52.2 
 
 
307 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  40.16 
 
 
324 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  31.69 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  28.47 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  28.78 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  29.93 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  33.21 
 
 
291 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  29.37 
 
 
311 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
622 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  31.67 
 
 
291 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  31.42 
 
 
314 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  26.04 
 
 
622 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  31.42 
 
 
314 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  28.57 
 
 
311 aa  99  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  28.37 
 
 
311 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  28.37 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  26.14 
 
 
304 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.5 
 
 
383 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.19 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  27.13 
 
 
596 aa  73.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  23.35 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.51 
 
 
592 aa  65.5  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  26.32 
 
 
595 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.49 
 
 
611 aa  63.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  25.88 
 
 
317 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  26.69 
 
 
619 aa  60.8  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  24.45 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.68 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  20.18 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  26.13 
 
 
263 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  25.35 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.39 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  25.26 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  23.97 
 
 
589 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  25 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  25 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.94 
 
 
590 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  25.3 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  22.58 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  24.1 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  28.12 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  23.53 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48664  predicted protein  26.75 
 
 
504 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00116938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  26.51 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>