21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4016 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  29.91 
 
 		 338 aa  90.5  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  62.16 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  25.29 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 622 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  42.59 
 
 		 622 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  29.83 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  29.83 
 
 		 311 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  31.73 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  22.52 
 
 		 383 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  52.5 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  52.5 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  29.28 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.07 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  29.81 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2071  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 		 338 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 		 379 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3824  hypothetical protein  35.71 
 
 		 406 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372888  normal  0.874565 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  43.9 
 
 		 267 aa  42  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>