29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1738 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 379 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  44.05 
 
 		 345 aa  292  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  43.2 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  45.54 
 
 		 353 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  38.55 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  34.53 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 		 367 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  37.9 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 434 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  44.57 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  40.91 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  42.05 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  41.81 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  41.24 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  38.04 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  23.69 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  23.55 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  24.52 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  22.92 
 
 		 589 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  22.11 
 
 		 622 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 622 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  22.44 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  21.07 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  21.52 
 
 		 595 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.55 
 
 		 590 aa  46.2  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  20.61 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  20.07 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>