52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4349 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  88.66 
 
 
291 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  32.64 
 
 
307 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  28.42 
 
 
622 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
622 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  31.67 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.82 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.73 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  28.62 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  32.24 
 
 
592 aa  72.8  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  24.44 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  27.07 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  24 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.4 
 
 
522 aa  65.9  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  27.72 
 
 
619 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.47 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.17 
 
 
611 aa  63.2  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.64 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  23.47 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  25.78 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  25.52 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  25.74 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  27.21 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  27.62 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  27.44 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  21.74 
 
 
266 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  27.44 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  22.63 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  20.95 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.22 
 
 
589 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  24.91 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  21.38 
 
 
349 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  22.83 
 
 
379 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  23.19 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  24.69 
 
 
596 aa  50.1  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  21.76 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  52.5 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  25.64 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00929  choline kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15930)  25.37 
 
 
730 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.390279 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119491  predicted protein  23.45 
 
 
345 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0654217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  22.22 
 
 
603 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  25.1 
 
 
595 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  21.33 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  20.61 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  35.71 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  26.34 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  27.11 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  18.43 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3364  aminoglycoside phosphotransferase  23.11 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  20.76 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  26.81 
 
 
339 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>