50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4005 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  100 
 
 
311 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  98.71 
 
 
311 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  98.39 
 
 
311 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  74.28 
 
 
311 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  74.35 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  54.37 
 
 
311 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  54.05 
 
 
311 aa  346  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  55.99 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  55.66 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  53.07 
 
 
313 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 
314 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  30.24 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  32.92 
 
 
314 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  26.97 
 
 
622 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  28.57 
 
 
305 aa  99  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
622 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  27 
 
 
317 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  26.12 
 
 
383 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  26.12 
 
 
383 aa  92.4  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  23.84 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  30.32 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  25.7 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.72 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  28.2 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  26.24 
 
 
595 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  25.09 
 
 
522 aa  72.8  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.11 
 
 
589 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  27.02 
 
 
592 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
596 aa  66.2  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  24.33 
 
 
619 aa  65.1  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  32.27 
 
 
590 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.64 
 
 
611 aa  64.7  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  25.08 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.62 
 
 
291 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  21.72 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.79 
 
 
603 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  29.28 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10156  ethanolamine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11550)  23.31 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.348276  normal  0.68664 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59919  ethanolamine kinase  19.39 
 
 
526 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.671475  normal  0.729563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  28.93 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  28.22 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  21.54 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01400  choline kinase, putative  27.67 
 
 
519 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.918034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  21.62 
 
 
266 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46453  predicted protein  32.43 
 
 
438 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>