259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1188 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  100 
 
 		 619 aa  1287    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  54.31 
 
 		 590 aa  657    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  58.6 
 
 		 595 aa  712    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  53.99 
 
 		 592 aa  631  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  53.95 
 
 		 596 aa  625  1e-178  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  49.83 
 
 		 611 aa  568  1e-160  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  49.24 
 
 		 589 aa  558  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  36.99 
 
 		 522 aa  341  2.9999999999999998e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 603 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  35 
 
 		 300 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  23.01 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 622 aa  130  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  31.98 
 
 		 227 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32.43 
 
 		 227 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.63 
 
 		 304 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  29.52 
 
 		 232 aa  87.8  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  23.6 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  22.93 
 
 		 383 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.49 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.09 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  24.15 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  25.71 
 
 		 307 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  31 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.11 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.72 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  24.63 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  22.11 
 
 		 313 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  24.24 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  25.09 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 384 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.73 
 
 		 262 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.31 
 
 		 249 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  44.59 
 
 		 225 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  24.24 
 
 		 311 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  45 
 
 		 227 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  23.24 
 
 		 311 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  38 
 
 		 393 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  32.2 
 
 		 232 aa  54.7  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  25 
 
 		 311 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.07 
 
 		 349 aa  54.3  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 		 227 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 254 aa  54.3  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  45 
 
 		 388 aa  53.9  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 254 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 383 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 228 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 		 400 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 228 aa  53.5  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.33 
 
 		 232 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  37.33 
 
 		 348 aa  52.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  53.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  38.57 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  34.23 
 
 		 247 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  27.51 
 
 		 305 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  41.38 
 
 		 244 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.89 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 326 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 828 aa  52.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  38.71 
 
 		 246 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  25 
 
 		 276 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  38.71 
 
 		 242 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.74 
 
 		 253 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  36.79 
 
 		 250 aa  51.6  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.85 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.74 
 
 		 253 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  34.26 
 
 		 253 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 616 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.03 
 
 		 630 aa  51.2  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.63 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2629  Nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 318 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.755027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.35 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  35.14 
 
 		 222 aa  50.8  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.35 
 
 		 400 aa  50.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0148  nucleotidyl transferase  25.6 
 
 		 236 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2547  Nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 313 aa  50.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  33.93 
 
 		 247 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 247 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0043  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 		 227 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 		 253 aa  50.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 230 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  26.84 
 
 		 291 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 		 230 aa  50.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 263 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  39.34 
 
 		 246 aa  49.7  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3469  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 289 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300387  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  44.64 
 
 		 243 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  27.97 
 
 		 239 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  29.03 
 
 		 255 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  29.03 
 
 		 255 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.03 
 
 		 255 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.27 
 
 		 289 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  38.67 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.67 
 
 		 405 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  40.35 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>