50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1307 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  100 
 
 
276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  33.47 
 
 
286 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  32.26 
 
 
293 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  31.99 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  26.05 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  24.7 
 
 
297 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  23.53 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  23.53 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  23.53 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  23.77 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  23.4 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  22.14 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  22.14 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  22.15 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  22.15 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  22.35 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  22.14 
 
 
274 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  22.15 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  22.15 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  22.22 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  22.75 
 
 
274 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  22.15 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  21.96 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  21.96 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  31.43 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  21.84 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  21.84 
 
 
274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  23.64 
 
 
589 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.36 
 
 
611 aa  56.6  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  25 
 
 
619 aa  52.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  21.77 
 
 
522 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  30 
 
 
263 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1911  aminoglycoside phophotransferase family protein  30.19 
 
 
293 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0214215  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 
595 aa  49.3  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  37.25 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  22.05 
 
 
287 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2179  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase, putative  26.85 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1900  kanamycin kinase (aminoglycoside phosphotransferase, gentamicin resistance protein)  26.85 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  28.32 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  23.73 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1870  aminoglycoside phosphotransferase  26.97 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  24.19 
 
 
343 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  25.26 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  22.86 
 
 
568 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  47.22 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
308 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  44.44 
 
 
307 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>