More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0157 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 
247 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.94 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  25.7 
 
 
249 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  28.4 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  26.94 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  29.13 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  30.12 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  24.11 
 
 
263 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
253 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  27.64 
 
 
247 aa  104  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  23.58 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  23.72 
 
 
241 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 
261 aa  94  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  22.16 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  25 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.05 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.61 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.97 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  20.25 
 
 
561 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  20.25 
 
 
561 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.36 
 
 
545 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  19.83 
 
 
561 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  22.58 
 
 
564 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  19.42 
 
 
561 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  19.42 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  20.41 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  24.52 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  20.58 
 
 
562 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  21.12 
 
 
578 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  20.4 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  27 
 
 
616 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  25.66 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.82 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.83 
 
 
568 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  24.06 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  19.42 
 
 
562 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  26.59 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.79 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.59 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.19 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  19.34 
 
 
562 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  23.66 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  22.66 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.22 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 
411 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  21.05 
 
 
562 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  21.46 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  33.33 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  26.89 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1404  hypothetical protein  23.58 
 
 
990 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.549738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  26.52 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  23.86 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  24.81 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32.46 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  26.89 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.83 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  23.39 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 
411 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.23 
 
 
411 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  22.73 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24.78 
 
 
400 aa  59.7  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  28.08 
 
 
411 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.28 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  21.47 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  21.54 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.89 
 
 
581 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  22.31 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 
384 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  22.69 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  25.91 
 
 
403 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  23.35 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  27.73 
 
 
414 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  24.27 
 
 
404 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  24.22 
 
 
266 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  33.01 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  23.6 
 
 
436 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  25 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  23.71 
 
 
399 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
230 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1608  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  30.57 
 
 
226 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  22.35 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  27.66 
 
 
227 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  26.15 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  21.24 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  21.8 
 
 
399 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>