More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1212 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  100 
 
 
436 aa  837    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  56.57 
 
 
428 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  37.6 
 
 
251 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34.51 
 
 
238 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1311  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.47 
 
 
205 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000926866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1375  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.45 
 
 
205 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
241 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  29.65 
 
 
241 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4806  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.16 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 
608 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.2 
 
 
200 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2920  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.32 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1498  CDP-diacylglycerol-inositol 3-phosphatidyltransferase  36.59 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.611071  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0977  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  35.38 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000321625  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2978  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.01 
 
 
201 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.22 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.84 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0118  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.56 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  34.62 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  28.93 
 
 
256 aa  67  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.13 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  0.387897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3539  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.13 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.45 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0605  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.88 
 
 
203 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.566054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3305  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 
247 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.856293 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.08 
 
 
194 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.91 
 
 
263 aa  63.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1397  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29 
 
 
210 aa  63.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  20.95 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  28.51 
 
 
253 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.88 
 
 
197 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  26.16 
 
 
250 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  29.51 
 
 
255 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1175  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  36.52 
 
 
530 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.1 
 
 
255 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 
246 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0331  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.71 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.98 
 
 
210 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  21.51 
 
 
253 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  24.12 
 
 
263 aa  60.1  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  21.57 
 
 
253 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4467  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 
226 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.760185 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  29.32 
 
 
254 aa  60.1  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.02 
 
 
255 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  29.02 
 
 
251 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  28.79 
 
 
254 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  27.76 
 
 
262 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2092  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.59 
 
 
215 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.93 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4296  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.63 
 
 
233 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636256  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1910  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.5 
 
 
226 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1526  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.8 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2404  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.4 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.365612  normal  0.328692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1902  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35 
 
 
204 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.11 
 
 
200 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  30.33 
 
 
260 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  30.33 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1352  hypothetical protein  36.04 
 
 
537 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100294  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  29.51 
 
 
255 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1904  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  29.52 
 
 
231 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0642  hypothetical protein  23.56 
 
 
215 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  28.79 
 
 
254 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  29.51 
 
 
255 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2334  hypothetical protein  31.21 
 
 
525 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.69 
 
 
255 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.65 
 
 
193 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  29.24 
 
 
255 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  29.24 
 
 
255 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0218  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  40.35 
 
 
199 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  28.7 
 
 
384 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.39 
 
 
203 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1228  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.98 
 
 
200 aa  57.4  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.6 
 
 
247 aa  57  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.94 
 
 
630 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.07 
 
 
223 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12631  phosphatidylinositol synthase pgsA1  34.81 
 
 
217 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.16 
 
 
235 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.1 
 
 
255 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0791  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.41 
 
 
218 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0197797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.59 
 
 
216 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.13 
 
 
263 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  40.95 
 
 
195 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3394  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.23 
 
 
231 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  28.46 
 
 
255 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2523  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.71 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.59725  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  23.48 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4241  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.23 
 
 
231 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4125  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.23 
 
 
231 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.484601  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  44.05 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
370 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1773  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  33.54 
 
 
211 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1376  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  39.8 
 
 
207 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0138452  normal  0.0276686 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.59 
 
 
200 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  32.4 
 
 
212 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>