106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0594 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  98.39 
 
 		 622 aa  1236    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  100 
 
 		 622 aa  1253    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  34.46 
 
 		 304 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25.04 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  35.77 
 
 		 267 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.26 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  32.98 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  24.64 
 
 		 589 aa  162  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  35.95 
 
 		 616 aa  147  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  31.77 
 
 		 383 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  31.41 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.11 
 
 		 611 aa  139  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  22.62 
 
 		 619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  23.75 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  26.74 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  28.83 
 
 		 313 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  29.41 
 
 		 307 aa  110  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 		 311 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  27.72 
 
 		 311 aa  109  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  28.79 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.51 
 
 		 603 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.56 
 
 		 314 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  27.82 
 
 		 311 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.56 
 
 		 314 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  27.92 
 
 		 291 aa  93.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  26.97 
 
 		 311 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  26.59 
 
 		 311 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  26.59 
 
 		 311 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  28.42 
 
 		 291 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.24 
 
 		 324 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  26.04 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.6 
 
 		 302 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  23.19 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  29.15 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  22.98 
 
 		 256 aa  66.6  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.63 
 
 		 270 aa  66.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  23.21 
 
 		 250 aa  66.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  23.56 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  27.64 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  25.11 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  24.18 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.37 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 241 aa  60.1  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  25.48 
 
 		 244 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  24.64 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.62 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.54 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 384 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 262 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  23.5 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.13 
 
 		 253 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  24.51 
 
 		 238 aa  54.7  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  26.63 
 
 		 383 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  34 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  29.21 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25.27 
 
 		 247 aa  52.8  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.61 
 
 		 253 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  23.43 
 
 		 237 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 254 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  27.06 
 
 		 564 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  21.28 
 
 		 338 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.75 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  23.95 
 
 		 247 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  25 
 
 		 249 aa  51.2  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  23.65 
 
 		 317 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  21.55 
 
 		 238 aa  50.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  29.06 
 
 		 219 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.95 
 
 		 225 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1283  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 192 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.01 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.66 
 
 		 249 aa  48.5  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  22.18 
 
 		 254 aa  48.5  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.95 
 
 		 561 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4016  hypothetical protein  42.59 
 
 		 255 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  22.91 
 
 		 246 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.95 
 
 		 561 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.95 
 
 		 561 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  28.81 
 
 		 219 aa  47.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.95 
 
 		 561 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  20.4 
 
 		 255 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  20.4 
 
 		 255 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  20.4 
 
 		 255 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  26.72 
 
 		 561 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.53 
 
 		 545 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.79 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  23.65 
 
 		 256 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  25.15 
 
 		 224 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.34 
 
 		 562 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  20.08 
 
 		 353 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  20 
 
 		 255 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  23.81 
 
 		 568 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  24.52 
 
 		 326 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>