63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  100 
 
 		 603 aa  1249    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.13 
 
 		 611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  34.46 
 
 		 589 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.61 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  31.28 
 
 		 592 aa  300  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  33.46 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  31.23 
 
 		 619 aa  293  5e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  31.2 
 
 		 522 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 622 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  24.51 
 
 		 622 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  28.7 
 
 		 227 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  28.25 
 
 		 227 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.59 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  23.62 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.1 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.95 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  23.64 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.15 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  26.47 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3364  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 		 262 aa  52.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 307 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  24.07 
 
 		 314 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  27.96 
 
 		 244 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  24.06 
 
 		 243 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  21.69 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  32.11 
 
 		 243 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4835  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.515713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4843  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 263 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4818  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4596  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4433  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4451  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4952  aminoglycoside phosphotransferase family protein  29.06 
 
 		 263 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.48 
 
 		 388 aa  48.5  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  27.84 
 
 		 243 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  23.7 
 
 		 314 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 393 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  28.85 
 
 		 255 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  20.78 
 
 		 266 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4532  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 263 aa  47  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  28.85 
 
 		 255 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0221  hypothetical protein  23.03 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.676637  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4813  aminoglycoside phosphotransferase family protein  28.21 
 
 		 265 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.21 
 
 		 255 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  32.29 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  22.18 
 
 		 266 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.11 
 
 		 223 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  24.59 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  25.88 
 
 		 311 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0423  aminoglycoside phosphotransferase family protein  27.35 
 
 		 265 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  25.88 
 
 		 311 aa  44.3  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  25.49 
 
 		 311 aa  44.3  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  25 
 
 		 243 aa  44.3  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 591 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  25.13 
 
 		 238 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  36.51 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.83 
 
 		 251 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  34.92 
 
 		 291 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  25.41 
 
 		 237 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  33.9 
 
 		 324 aa  43.5  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>