More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05790 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  62.5 
 
 
589 aa  752    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  100 
 
 
611 aa  1272    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  50.08 
 
 
595 aa  584  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  50.94 
 
 
596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  50.87 
 
 
592 aa  569  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  50 
 
 
590 aa  568  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1188  phosphotransferase enzyme family protein  49.83 
 
 
619 aa  568  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  37.64 
 
 
522 aa  383  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  34.13 
 
 
603 aa  344  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  31.11 
 
 
622 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
622 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  31.48 
 
 
227 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  31.02 
 
 
227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2028  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase-like protein  28.62 
 
 
300 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  30 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  28.76 
 
 
232 aa  94  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  27.64 
 
 
314 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  24.8 
 
 
383 aa  88.2  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  24.02 
 
 
383 aa  87.4  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  27.64 
 
 
314 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  26.57 
 
 
313 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  25.48 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  24.32 
 
 
311 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  25.98 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  25.69 
 
 
307 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  23.59 
 
 
311 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  28.07 
 
 
291 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 
400 aa  64.3  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  33.67 
 
 
241 aa  63.9  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 
262 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.23 
 
 
355 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  35.58 
 
 
384 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  35.51 
 
 
399 aa  62.4  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  32.38 
 
 
388 aa  61.2  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.19 
 
 
400 aa  60.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.19 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  27.17 
 
 
291 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.29 
 
 
568 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  36.19 
 
 
237 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  27.45 
 
 
578 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  24.62 
 
 
249 aa  58.9  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  24.64 
 
 
311 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  25 
 
 
256 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.77 
 
 
374 aa  58.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
254 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  33.01 
 
 
401 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
238 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  24.64 
 
 
311 aa  57  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  23.36 
 
 
276 aa  56.6  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  41.1 
 
 
228 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
227 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.69 
 
 
383 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 
222 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
253 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.25 
 
 
354 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  27.71 
 
 
305 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 
227 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.35 
 
 
246 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  54.7  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.5 
 
 
405 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  40 
 
 
228 aa  54.7  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
232 aa  54.3  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.23 
 
 
232 aa  53.9  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  31.73 
 
 
384 aa  53.9  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  38.71 
 
 
246 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  32.26 
 
 
302 aa  53.5  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.35 
 
 
253 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  24.29 
 
 
311 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  35.92 
 
 
247 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
393 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  40.35 
 
 
253 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  25.12 
 
 
293 aa  53.5  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  43.64 
 
 
244 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
830 aa  53.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 
230 aa  53.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  38.98 
 
 
230 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
392 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  38.71 
 
 
242 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  36.79 
 
 
237 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1735  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.69 
 
 
289 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
403 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2183  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.26 
 
 
289 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  25.26 
 
 
311 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  33.88 
 
 
253 aa  52  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
229 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
776 aa  52  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  28.68 
 
 
229 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  28.32 
 
 
476 aa  52  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.99 
 
 
294 aa  51.6  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  27.84 
 
 
302 aa  51.6  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.16 
 
 
354 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  28.18 
 
 
341 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  25.24 
 
 
821 aa  52  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  26.13 
 
 
247 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
248 aa  51.2  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  24.41 
 
 
263 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  26.06 
 
 
411 aa  50.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  32.56 
 
 
253 aa  50.8  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1737  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.26 
 
 
293 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793832  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  25.69 
 
 
414 aa  50.8  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>