18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1347 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  31.98 
 
 		 240 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  23.58 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  27.81 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  23.35 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  23.28 
 
 		 293 aa  49.7  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.56 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  20.08 
 
 		 522 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  22.66 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  22.85 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  22.66 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  22.66 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2343  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.421232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  23.7 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  23.94 
 
 		 338 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  37.93 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  18.79 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf796  hypothetical protein  24.37 
 
 		 484 aa  42.4  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>