33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1889 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 349 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  51.41 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  43.52 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  43.2 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  35.4 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  46.15 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  33.51 
 
 		 392 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  44.51 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  45.6 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  36.83 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  41.21 
 
 		 382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  41.21 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  41.21 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  24.18 
 
 		 622 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25.79 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  22.42 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  27.2 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  21.28 
 
 		 267 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4339  hypothetical protein  22.34 
 
 		 313 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.847444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  22.54 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  21.83 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  21.38 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  20.19 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  20.83 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4351  homoserine kinase type II (protein kinase fold)  20.65 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  22.73 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4742  hypothetical protein  19.17 
 
 		 313 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  22.05 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>