22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1663 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
367 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  53.94 
 
 
382 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  57.33 
 
 
389 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  55.42 
 
 
392 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  56.67 
 
 
384 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  49.61 
 
 
379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 
409 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  49.42 
 
 
434 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  60 
 
 
434 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  35.99 
 
 
345 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  38.73 
 
 
353 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  34.78 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  37.27 
 
 
332 aa  170  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  37.11 
 
 
379 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  33.97 
 
 
342 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  26.42 
 
 
302 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  40.68 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  21.64 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  18.25 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  18.25 
 
 
314 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  31.11 
 
 
244 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>