22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1454 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 342 aa  704    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  38.54 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  39.47 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  36.77 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  39.16 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  35.13 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  34.51 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  34.82 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 		 356 aa  149  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  34.12 
 
 		 384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 389 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  31.64 
 
 		 379 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  38.65 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  37.43 
 
 		 434 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  37.13 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.51 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 622 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  20.7 
 
 		 622 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  37.5 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  22.22 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  22.22 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>