31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1288 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  100 
 
 		 266 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  98.12 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  36.89 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  32.2 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  29.51 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  27.56 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  25.68 
 
 		 383 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  27.64 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 622 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  25.29 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3530  aminoglycoside phosphotransferase  26.79 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410504  normal  0.726501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  24.8 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0858  homoserine kinase  28.74 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000127482  hitchhiker  0.000000000719161 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4349  Choline/ethanolamine kinase  20.95 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4020  Choline/ethanolamine kinase  21.34 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  24.32 
 
 		 611 aa  49.7  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  22.54 
 
 		 349 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  20.08 
 
 		 314 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  21.43 
 
 		 345 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  21.08 
 
 		 589 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  20.08 
 
 		 314 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  26.71 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  22.18 
 
 		 603 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  24.52 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  21.67 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  19.58 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  19.09 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0064  hypothetical protein  27.63 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  24.39 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  20.54 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  21.54 
 
 		 311 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>