19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2307 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 409 aa  838    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  87.33 
 
 		 434 aa  745    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  85.02 
 
 		 434 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  58.74 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  50.12 
 
 		 382 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  50.99 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  50.37 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  49.63 
 
 		 384 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 		 367 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  43.19 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  41.15 
 
 		 345 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  43.17 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  42.94 
 
 		 353 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  33.2 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  37.2 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  32.65 
 
 		 302 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 		 244 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  40.38 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>