19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2377 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  87.33 
 
 		 409 aa  745    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 434 aa  891    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  88.71 
 
 		 434 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  54.77 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 		 382 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  48.26 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 		 389 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  47.47 
 
 		 384 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  60.54 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  44.33 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  42.06 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  43.72 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  43.27 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  36.27 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 342 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  33.67 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  31.03 
 
 		 244 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  34.55 
 
 		 267 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>