22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2318 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2318  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 356 aa  724    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1529  hypothetical protein  40.29 
 
 		 332 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1889  aminoglycoside phosphotransferase  38.1 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1663  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 367 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2712  hypothetical protein  37.54 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2749  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.589565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2481  aminoglycoside phosphotransferase  34.99 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.469146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1831  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0556162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1738  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1797  aminoglycoside phosphotransferase  33.51 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2497  aminoglycoside phosphotransferase  44.26 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.403294  hitchhiker  0.00457096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2377  aminoglycoside phosphotransferase  43.72 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.1275  normal  0.630893 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1454  aminoglycoside phosphotransferase  33.62 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.599627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2307  aminoglycoside phosphotransferase  43.17 
 
 		 409 aa  145  9e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1805  aminoglycoside phosphotransferase  41.8 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1844  aminoglycoside phosphotransferase  41.8 
 
 		 392 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.812957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  30.95 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.95 
 
 		 603 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  34.55 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  35.09 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>