44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2489 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  100 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  87.46 
 
 		 297 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  45.8 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  45.8 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  45.8 
 
 		 295 aa  268  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  48.03 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  48.52 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  41.24 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  38.94 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  38.94 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  38.94 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  39.8 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  39.8 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  36.63 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  36.63 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  36.63 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  36.63 
 
 		 274 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  36.63 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  36.63 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  36.63 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  35.95 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  36.21 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  32.82 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  24.7 
 
 		 276 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  23.51 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  20.77 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  20.68 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  28.06 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  23.24 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  26.32 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  32.29 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  23.9 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  23.33 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  24.29 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  25.81 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  25.35 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  32.14 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 		 223 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  30.3 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  21 
 
 		 383 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  18.79 
 
 		 279 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>