44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2795 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  87.46 
 
 
297 aa  518  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  48.03 
 
 
287 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  44.06 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  44.06 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  44.06 
 
 
288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  42.49 
 
 
289 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  46.3 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  38.11 
 
 
274 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  38.11 
 
 
274 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  38.11 
 
 
274 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  38.11 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  38.11 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  38.11 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  38.11 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  37.7 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  37.7 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  39.64 
 
 
274 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  41.43 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  41.43 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  41.43 
 
 
274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  40.95 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  34.22 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  26.05 
 
 
276 aa  89.4  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  20.72 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  20.97 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  25.35 
 
 
240 aa  62.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  19.92 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  26.83 
 
 
263 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  23.48 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  33.68 
 
 
238 aa  56.6  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  24.7 
 
 
249 aa  55.1  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  25.74 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2590  choline/ethanolamine kinase  24.45 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  22.81 
 
 
302 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  20.94 
 
 
383 aa  49.3  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1409  aminoglycoside phosphotransferase  23.71 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  20.82 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  20.58 
 
 
383 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  28.65 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1771  hypothetical protein  27.87 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.384061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  29.85 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  30.23 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 
223 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>