32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2161 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  100 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  99.64 
 
 		 274 aa  557  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  99.64 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  98.91 
 
 		 274 aa  553  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  98.91 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  66.67 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  66.3 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  67.03 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  66.3 
 
 		 274 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  65.93 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  65.93 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  65.93 
 
 		 274 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  65.57 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  65.57 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  57.41 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  41.43 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  34.07 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  37.41 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  38.94 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  38.07 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  38.07 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  38.07 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  41.12 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  22.15 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  24.23 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.27 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  27.49 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  42.86 
 
 		 308 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  24.03 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  38.96 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 603 aa  42.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>