40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1483 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  50.18 
 
 		 293 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  50.18 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  32.95 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  23.62 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  20.68 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  22.05 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  22.05 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  22.05 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  24.37 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  19.92 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  22.31 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  27.81 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  25 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  21.08 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  26.87 
 
 		 522 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  30.54 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  26.05 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  27.53 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  24.02 
 
 		 356 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  23.1 
 
 		 352 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5718  aminoglycoside phosphotransferase  23.61 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42574  predicted protein  23.84 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.202848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  25.25 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  26.4 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  25.71 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  21.84 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  24.17 
 
 		 337 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  25.9 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  21.89 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  21.89 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  26.53 
 
 		 622 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  22.94 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  22.48 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  23.04 
 
 		 354 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  22.68 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  27.31 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  21.89 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  21.76 
 
 		 354 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>