33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2217 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  100 
 
 
274 aa  557  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  98.54 
 
 
274 aa  551  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  98.91 
 
 
274 aa  551  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  98.18 
 
 
274 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  98.54 
 
 
274 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  98.54 
 
 
274 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  98.18 
 
 
274 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  98.18 
 
 
274 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  97.08 
 
 
274 aa  542  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  66.3 
 
 
274 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  66.67 
 
 
274 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  66.3 
 
 
274 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  65.93 
 
 
274 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  65.93 
 
 
274 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  55.47 
 
 
274 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  37.6 
 
 
289 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  37.7 
 
 
297 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  34.74 
 
 
287 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  37.1 
 
 
295 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  37.1 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  37.1 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  36.21 
 
 
297 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  38.68 
 
 
290 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  24.05 
 
 
293 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  22.75 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  23.29 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  27.08 
 
 
324 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  32.08 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  32.94 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  24.43 
 
 
356 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  24.43 
 
 
356 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>