59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1923 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  100 
 
 
289 aa  587  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  55.12 
 
 
288 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  55.12 
 
 
288 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  54.77 
 
 
295 aa  299  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  47.41 
 
 
287 aa  229  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  41.24 
 
 
297 aa  221  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  42.49 
 
 
297 aa  218  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  42.65 
 
 
290 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  38.4 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  38.4 
 
 
274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  38.75 
 
 
274 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  38.75 
 
 
274 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  38 
 
 
274 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  36.93 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  38 
 
 
274 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  37.6 
 
 
274 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  38.33 
 
 
274 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  37.6 
 
 
274 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  34.07 
 
 
274 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  34.07 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  34.07 
 
 
274 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  33.7 
 
 
274 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  34.07 
 
 
274 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  26.62 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  24.15 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  23.77 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  24.37 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1609  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  24.39 
 
 
263 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1585  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  23.73 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.99 
 
 
250 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.1 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.346641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  61.76 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  61.76 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  22.18 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  58.82 
 
 
303 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4469  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00940393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1891  aminoglycoside phosphotransferase  26.9 
 
 
350 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  24.59 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5725  aminoglycoside phosphotransferase  33.8 
 
 
287 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  23.67 
 
 
250 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  21.03 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0596  hypothetical protein  24.69 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  25.89 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  20 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1288  choline/ethanolamine kinase family protein  19.09 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.006168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  36.84 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  22.99 
 
 
268 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  22.5 
 
 
244 aa  43.9  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1461  LicA protein  36.84 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  23.7 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1107  choline/ethanolamine kinase family protein  19.34 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.531729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3288  choline/ethanolamine kinase  28 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2289  aminoglycoside phosphotransferase  24.04 
 
 
307 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0209  aminoglycoside phosphotransferase  30.37 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  30.61 
 
 
261 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  23.93 
 
 
282 aa  42.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0284  putative aminoglycoside phosphotransferase  28.74 
 
 
351 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.846831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>