34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1605 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  100 
 
 
287 aa  568  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  56.43 
 
 
290 aa  276  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  48.03 
 
 
297 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  48.03 
 
 
297 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  48.23 
 
 
288 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  48.23 
 
 
288 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  48.23 
 
 
295 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  47.41 
 
 
289 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  34.63 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  34.74 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  35.44 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  35.44 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  35.44 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  35.44 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  34.74 
 
 
274 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  35.09 
 
 
274 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  34.39 
 
 
274 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  37.41 
 
 
274 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  38.16 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  37.41 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  37.41 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  37.41 
 
 
274 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  36.71 
 
 
274 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  24.72 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  23.05 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  23.4 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  23.81 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  23.35 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  21.74 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  31.11 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  55.88 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  55.88 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf798  PTS lichenan-specific IIa component  20.63 
 
 
249 aa  42.4  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  35.16 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>