66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1755 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 307 aa  603  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  95.78 
 
 		 308 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  83.55 
 
 		 303 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  45.56 
 
 		 286 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  45.1 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  34.35 
 
 		 265 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  26.56 
 
 		 268 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  32.4 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  25.67 
 
 		 249 aa  97.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  24.41 
 
 		 250 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  26.19 
 
 		 250 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  25.3 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  21.65 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  27.82 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  24.58 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  22.82 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  22.67 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  33.18 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  26.09 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1926  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00274282  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  61.76 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  26.67 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0322  aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.0988961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  52.17 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  55.88 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  55.88 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  55.88 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  30.73 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  36.36 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  30.43 
 
 		 522 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  42.86 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  27.53 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  29.44 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  42.86 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  42.86 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  42.86 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2551  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  18.86 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6367  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  38.71 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  41.27 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  27.23 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  31.37 
 
 		 589 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  34.4 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  41.18 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  29.56 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  55.88 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 603 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3604  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>