65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2091 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2091  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
308 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100856  normal  0.0330473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1755  aminoglycoside phosphotransferase  95.78 
 
 
307 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1539  aminoglycoside phosphotransferase  85.62 
 
 
303 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.791397  normal  0.0213289 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5542  aminoglycoside phosphotransferase  47.37 
 
 
286 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.0139548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0048  aminoglycoside phosphotransferase  45.88 
 
 
268 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000121913  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1851  aminoglycoside phosphotransferase  31.93 
 
 
267 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1212  aminoglycoside phosphotransferase  31.84 
 
 
268 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0641  aminoglycoside phosphotransferase  34.73 
 
 
265 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2364  aminoglycoside phosphotransferase  29.37 
 
 
261 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.488578 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1247  hypothetical protein  27 
 
 
268 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2116  aminoglycoside phosphotransferase  32.54 
 
 
273 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.901161  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0754  aminoglycoside phosphotransferase  25.67 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000796745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2588  phosphotransferase enzyme family protein, putative  24.41 
 
 
250 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.474543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2774  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
268 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.328597  decreased coverage  0.0000000000775217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2358  hypothetical protein  26.19 
 
 
250 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000130107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3927  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 
248 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2593  phosphotransferase enzyme family protein, putative  24.49 
 
 
249 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.03086e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2391  aminoglycoside phosphotransferase  24.58 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0137675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  21.99 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2945  aminoglycoside phosphotransferase  28.02 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.263618  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0424  aminoglycoside phosphotransferase  23.08 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0390  aminoglycoside phosphotransferase  25.79 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2979  aminoglycoside phosphotransferase  32.99 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0251583  normal  0.510052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0478  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 
249 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1926  aminoglycoside phosphotransferase  29.45 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00274282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6301  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4730  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 
216 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  61.76 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4407  aminoglycoside phosphotransferase  25.72 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219591  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1863  aminoglycoside phosphotransferase  27.39 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0353182  normal  0.189268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0322  aminoglycoside phosphotransferase  31.48 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402351  normal  0.0988961 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  55.88 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  55.88 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  55.88 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  52.17 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2919  hypothetical protein  31.1 
 
 
316 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  30.43 
 
 
522 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  47  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  36.36 
 
 
274 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2161  thiamine kinase  42.86 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000171857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1322  thiamine kinase  42.86 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209926  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1307  thiamine kinase  42.86 
 
 
274 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.435558  hitchhiker  0.000000123705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1977  thiamine kinase  42.86 
 
 
274 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  38.71 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6367  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
218 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2913  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.605881  normal  0.0304684 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2027  aminoglycoside phosphotransferase  29.27 
 
 
589 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32446  hitchhiker  0.00000463346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2551  hypothetical aminoglycoside phosphotransferase  18.86 
 
 
192 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1284  thiamine kinase  41.27 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1959  aminoglycoside phosphotransferase  30.19 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  26.4 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0105  aminoglycoside phosphotransferase  27.89 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0679113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5102  hypothetical protein  41.18 
 
 
319 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  47.27 
 
 
274 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  55.88 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  40.54 
 
 
603 aa  42.7  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20250  predicted aminoglycoside phosphotransferase  28.33 
 
 
315 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.227699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2322  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  22.12 
 
 
109 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00287241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>