35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01523 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01523  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003999  hypothetical protein  74.06 
 
 		 293 aa  477  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1483  hypothetical protein  51.09 
 
 		 286 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0577113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1307  putative antibiotic resistance protein  31.99 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.236595  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1923  thiamine kinase  24.15 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.592165  hitchhiker  0.0000295844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1605  Thiamine kinase  23.05 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  26.51 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2489  thiamine kinase  20.77 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.385558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3408  aminoglycoside phosphotransferase-like  24.15 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2817  hypothetical protein  23.93 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1591  thiamine kinase  23.93 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1699  thiamine kinase  23.93 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2795  thiamine kinase  20.97 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1636  Thiamine kinase  25.76 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00206508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0797  choline kinase involved in LPS biosynthesis- like protein  26.24 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02802  Choline kinase involved in LPS biosynthesis  27.47 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.994431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1228  thiamine kinase  23.92 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000138774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2217  thiamine kinase  23.29 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.305873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1083  aminoglycoside phosphotransferase  23.6 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000707357  unclonable  0.00000000000458118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1486  thiamine kinase  23.29 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01110  hypothetical protein  23.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.771897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2541  thiamine kinase  23.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2020  thiamine kinase  26.25 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.379564  hitchhiker  0.0000784787 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2495  thiamine kinase  23.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.490568  hitchhiker  0.000000295812 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1229  thiamine kinase  23.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01102  thiamin kinase  23.92 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.12 
 
 		 611 aa  53.5  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1621  thiamine kinase  25 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0623667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0974  aminoglycoside phosphotransferase  27.37 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00708128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1347  aminoglycoside phosphotransferase  23.28 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.743543  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  21.69 
 
 		 603 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  25.45 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  25.53 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3563  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0866  hypothetical protein  18.5 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>