27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2596 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2596  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.647212 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7266  aminoglycoside phosphotransferase  58.57 
 
 
321 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3751  aminoglycoside phosphotransferase  48.77 
 
 
326 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4046  aminoglycoside phosphotransferase  48.77 
 
 
326 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.411074  normal  0.268471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4006  aminoglycoside phosphotransferase  47.42 
 
 
326 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0105  aminoglycoside phosphotransferase  36.27 
 
 
314 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0176137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0044  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1456  hypothetical protein  37.41 
 
 
314 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3055  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214453  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3189  hypothetical protein  32.39 
 
 
317 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3054  choline/ethanolamine kinase:aminoglycoside phosphotransferase  24.61 
 
 
311 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.246659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3188  choline/ethanolamine kinase  23.68 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7265  Ethanolamine kinase  23.36 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0106  choline/ethanolamine kinase  25.44 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1457  putative choline kinase  25.09 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2597  putative ethanolamine kinase  24.29 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0045  Choline/ethanolamine kinase  23.29 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4005  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.354936  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4045  Choline/ethanolamine kinase  25 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3750  choline/ethanolamine kinase  25 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.375489 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  21.63 
 
 
622 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  21.63 
 
 
622 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1359  hypothetical protein  24.04 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1363  hypothetical protein  23.5 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.88 
 
 
549 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  35 
 
 
560 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  35 
 
 
560 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>