155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3471 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
387 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  99.22 
 
 
387 aa  774    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  77.62 
 
 
372 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  69.67 
 
 
427 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  72.21 
 
 
333 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  65.46 
 
 
362 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  59.9 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  56.89 
 
 
388 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  59.67 
 
 
360 aa  414  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  58.14 
 
 
331 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  56.74 
 
 
352 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  54.42 
 
 
357 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  54.13 
 
 
357 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  52.99 
 
 
344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  52.15 
 
 
348 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  52.45 
 
 
349 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
349 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  53.69 
 
 
350 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  51.87 
 
 
349 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  52.02 
 
 
349 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  52.02 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  51.59 
 
 
349 aa  328  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  51.23 
 
 
393 aa  328  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  50.15 
 
 
346 aa  323  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  53.68 
 
 
341 aa  322  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  51.34 
 
 
344 aa  322  8e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  52.31 
 
 
401 aa  318  7e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  47.59 
 
 
348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  51.72 
 
 
344 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  51.44 
 
 
401 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  51.15 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  51.15 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  51.15 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  51.15 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  51.15 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  47.35 
 
 
363 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  48.95 
 
 
333 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  47.47 
 
 
363 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  52.17 
 
 
330 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  47.49 
 
 
333 aa  297  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  49.28 
 
 
338 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  48.71 
 
 
338 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  51.72 
 
 
341 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  50.64 
 
 
339 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  47.19 
 
 
340 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  54 
 
 
340 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
339 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  47.13 
 
 
341 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 
339 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  48.72 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  48.84 
 
 
336 aa  263  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
339 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  42.9 
 
 
341 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  45.45 
 
 
323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  43 
 
 
351 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  43.93 
 
 
341 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  41.37 
 
 
359 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  35.93 
 
 
325 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  43.97 
 
 
340 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  35.63 
 
 
325 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  39.62 
 
 
340 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  39.02 
 
 
334 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  41.78 
 
 
363 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  40.9 
 
 
348 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  39.47 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  41.04 
 
 
347 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  39.21 
 
 
334 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  39.17 
 
 
361 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  38.46 
 
 
348 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  40.46 
 
 
361 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  40.97 
 
 
368 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  37.29 
 
 
368 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  40.2 
 
 
363 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  40.2 
 
 
363 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  40.33 
 
 
341 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  37.84 
 
 
345 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  32.11 
 
 
312 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  41.16 
 
 
339 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  42.47 
 
 
344 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  36.78 
 
 
342 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  38.02 
 
 
365 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  38.02 
 
 
329 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  36.25 
 
 
345 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  39.29 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  33.79 
 
 
379 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  40.86 
 
 
346 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  35.76 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  35.95 
 
 
384 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  35.69 
 
 
379 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  35.31 
 
 
328 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  38.65 
 
 
342 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  38.65 
 
 
342 aa  155  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  36.59 
 
 
360 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  39.93 
 
 
328 aa  142  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  36.91 
 
 
327 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3705  aminoglycoside phosphotransferase  31.89 
 
 
348 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4941  protein of unknown function UPF0079  33.75 
 
 
540 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.267606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3847  aminoglycoside phosphotransferase  32.83 
 
 
347 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.899944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>