212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1318 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  51.82 
 
 
254 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  52.19 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  53.01 
 
 
255 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  53.01 
 
 
255 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  52.61 
 
 
255 aa  249  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  53.01 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  53.01 
 
 
260 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  53.01 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  53.01 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  53.01 
 
 
255 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  52.23 
 
 
251 aa  248  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  50.6 
 
 
254 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  51.63 
 
 
255 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  51.22 
 
 
255 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  51.22 
 
 
255 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  51.22 
 
 
255 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  51.22 
 
 
255 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  50.81 
 
 
255 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  49.03 
 
 
255 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  29.27 
 
 
241 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.53 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  28.63 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  30.08 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  30.8 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.19 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.42 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  22.71 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  25.9 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.03 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.29 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.69 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  26.23 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.46 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.05 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.05 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.22 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27 
 
 
630 aa  66.2  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.35 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  24.31 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.53 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  26.83 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  27.67 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  25.91 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.89 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.91 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.31 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.51 
 
 
223 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.1 
 
 
545 aa  60.1  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  28.46 
 
 
242 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0608  MarR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
622 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32.31 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0594  choline/ethanolamine kinase family protein  22.98 
 
 
622 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0311348  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32.31 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  45.16 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  34.02 
 
 
522 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  45.16 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  50 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
388 aa  56.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.17 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  36.57 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  26.29 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  50.77 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  50.77 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.39 
 
 
616 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  22.82 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  33.09 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  40 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  20.77 
 
 
247 aa  52  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
224 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  35 
 
 
228 aa  52  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.02 
 
 
428 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  34.45 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.64 
 
 
400 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  33.71 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  26.75 
 
 
436 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  24.53 
 
 
397 aa  49.3  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  25.9 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  43.33 
 
 
220 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
248 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  43.1 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  25.77 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.18 
 
 
592 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.42 
 
 
575 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  48.28 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0557  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  42.03 
 
 
460 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  28.06 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  42.42 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.7 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  34.26 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  43.08 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.41 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>