More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3958 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  99.63 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  75.97 
 
 		 263 aa  363  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  73.36 
 
 		 247 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  65.53 
 
 		 272 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  64.34 
 
 		 245 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  66.67 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  63.07 
 
 		 236 aa  298  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  56.79 
 
 		 232 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  51.61 
 
 		 234 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  45.25 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  45.28 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  47.13 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  44.49 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  44.09 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  47.54 
 
 		 232 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  41.91 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  46.22 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  48.37 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  41.63 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  48.36 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  44.84 
 
 		 245 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 240 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  44.4 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  45.2 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  46.94 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  47.33 
 
 		 223 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  44.4 
 
 		 239 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  48.57 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  43.6 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  46.91 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  43.6 
 
 		 242 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  45.68 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  45.34 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  45.71 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  41.53 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  44.35 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  45.87 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  42.8 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  47.95 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  46.94 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  46.03 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  46.03 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  42.51 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  47.13 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  43.67 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  41.53 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  44.22 
 
 		 236 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  42 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  41.2 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  41.83 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  41.57 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  41.57 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  41.57 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  41.57 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  41.57 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  41.43 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  41.53 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  41.34 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  42.57 
 
 		 226 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  41.18 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  41.94 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  40.96 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  42.34 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  41.46 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  39.75 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  42.23 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  41.43 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  46.98 
 
 		 210 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  43.8 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  42.45 
 
 		 241 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  41.43 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  40.8 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  40.4 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  41.87 
 
 		 223 aa  142  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  38.21 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.7 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  40.33 
 
 		 232 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  37.7 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  47.35 
 
 		 222 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  38.21 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  40.4 
 
 		 236 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  37.75 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  42.62 
 
 		 223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  36.33 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  37.14 
 
 		 220 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  38.37 
 
 		 230 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  32.53 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  32.4 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  33.07 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  31.35 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  30.8 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>