24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1164 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  100 
 
 		 294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.46 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  25.38 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  26.7 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.06 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.27 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  23.66 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  25.53 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  25.53 
 
 		 255 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.32 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  24.73 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.47 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  24.75 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  24.19 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  24.19 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  22.1 
 
 		 256 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03480  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 490 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>