55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1250 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  100 
 
 
608 aa  1193    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.51 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  31.2 
 
 
436 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  30.68 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.62 
 
 
243 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
261 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  27.87 
 
 
256 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.21 
 
 
383 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  29.15 
 
 
251 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.58 
 
 
358 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
253 aa  55.1  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
247 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  26.87 
 
 
411 aa  54.7  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  24.23 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  23.85 
 
 
411 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.5 
 
 
344 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  25.95 
 
 
245 aa  52.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  28.83 
 
 
411 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 
254 aa  51.6  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  24.03 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.38 
 
 
393 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.17 
 
 
354 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 
411 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  23.74 
 
 
374 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
414 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.28 
 
 
244 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  30.07 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  37.21 
 
 
255 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  29.5 
 
 
228 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  28.51 
 
 
247 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  24.22 
 
 
329 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
257 aa  48.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  25.11 
 
 
384 aa  48.5  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.4 
 
 
243 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  27.89 
 
 
254 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.3 
 
 
359 aa  48.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  30.66 
 
 
364 aa  47.8  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
239 aa  47.4  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  24.6 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 
230 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  23.48 
 
 
248 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  27.01 
 
 
384 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  24.87 
 
 
247 aa  45.8  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.43 
 
 
249 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  25 
 
 
385 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  41.54 
 
 
240 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.88 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
388 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  25.6 
 
 
256 aa  44.3  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.17 
 
 
393 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  24.48 
 
 
397 aa  44.3  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  21.86 
 
 
243 aa  43.5  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>