104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1940 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 338 aa  687    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  62.57 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  61.7 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2223  BNR repeat-containing protein  59.94 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1807  BNR repeat-containing protein  56.21 
 
 		 337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.120061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  57.74 
 
 		 337 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  57.44 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  54.9 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  54.3 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  53.71 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  54.3 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1727  BNR repeat-containing protein  57.44 
 
 		 335 aa  359  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  53.77 
 
 		 336 aa  348  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  42.37 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  42.21 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  37.9 
 
 		 363 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  35.92 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  35.34 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.6 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  40.21 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  39.86 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  36.28 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  39.15 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  35.62 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  37.94 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  33.44 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.1 
 
 		 299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  33.44 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  29.03 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  30.25 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  30.7 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.99 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  28.85 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  33.45 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.87 
 
 		 359 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0646  hypothetical protein  28.22 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0104627  normal  0.241315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.37 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  28.96 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  29.9 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3921  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.25 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6866  glycosyl hydrolase  27.06 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0347916  normal  0.0962421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  27.62 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  29.36 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4061  glycosyl hydrolase, BNR repeat protein  27.25 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369281  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  29.55 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  28.72 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.72 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.65 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  26.87 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.01 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  27.42 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.8 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.88 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.33 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  28.33 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4028  glycosyl hydrolase, BNR repeat  26.52 
 
 		 355 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0574682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 397 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.9 
 
 		 897 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.41 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  28.57 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  29.3 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  34.95 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  27.95 
 
 		 661 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.04 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  30.06 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  24.57 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.98 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.88 
 
 		 742 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  32.32 
 
 		 421 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 352 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.91 
 
 		 698 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  41.89 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  40 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  40 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  29.5 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  24.5 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  23.21 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  30.77 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  26.09 
 
 		 372 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  24.2 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  29.13 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  30.07 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  28.09 
 
 		 1527 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0622  hypothetical protein  29.29 
 
 		 403 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  22.78 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  29.37 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1219  metallophosphoesterase  38.33 
 
 		 759 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  40 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  27.27 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  34.09 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  36.23 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4449  hypothetical protein  33.85 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>