80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0228 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0228  Ycf48-like protein  100 
 
 		 333 aa  672    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0201  Ycf48-like protein  84.98 
 
 		 333 aa  583  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.345386  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  64.48 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03221  Ycf48-like protein  62.83 
 
 		 339 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03761  Ycf48-like protein  59.17 
 
 		 338 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.156925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1662  Ycf48-like protein  59.17 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243445  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03201  Ycf48-like protein  56.55 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03191  Ycf48-like protein  56.55 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0298  Ycf48-like protein  56.85 
 
 		 338 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03291  Ycf48-like protein  54.14 
 
 		 337 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.307197  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1178  Ycf48-like protein  48.88 
 
 		 349 aa  298  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  47.35 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3503  Ycf48-like protein  43.5 
 
 		 337 aa  295  7e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4148  Ycf48-like protein  43.81 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4188  Ycf48-like protein  43.81 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  42.6 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  42.47 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1238  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  43.28 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47343  predicted protein  37.2 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0770421  hitchhiker  0.000226051 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47413  predicted protein  36.25 
 
 		 408 aa  205  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  25.62 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.72 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3724  hypothetical protein  35.04 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.84 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  28.22 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  33.58 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3201  BNR domain-containing protein  29.3 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  30.88 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.95 
 
 		 897 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  33.58 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  26.63 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2164  glycosyl hydrolase  27.16 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  29.9 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4345  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.63 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  27.72 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6841  hypothetical protein  31.4 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109659  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4326  glycosyl hydrolase, BNR repeat  29.76 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.0660823 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6391  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.82 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4436  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.76 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.501856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2810  glycosyl hydrolase  27.8 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  30.6 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1364  BNR/Asp-box repeat-containing protein  29.69 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.27216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  27.38 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2667  hypothetical protein  26.45 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.166994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0966  hypothetical protein  25.62 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  24.41 
 
 		 742 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0132  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.09 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.92 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.36 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3779  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.62 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00208447  decreased coverage  0.000226347 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5822  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.7 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2271  hypothetical protein  25.16 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.160712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5038  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.7 
 
 		 322 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  24.91 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4357  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.24 
 
 		 322 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  27.83 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2138  BNR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  23.59 
 
 		 421 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 336 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 332 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2468  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.97 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000564935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1753  BNR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0888292  normal  0.639516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2245  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.42 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000222416  hitchhiker  0.00000000000000277962 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2442  BNR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1590  BNR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  27.93 
 
 		 324 aa  46.2  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1909  BNR repeat protein  21.54 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00042683  normal  0.120925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2555  BNR repeat-containing protein  21.54 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0401334  normal  0.0919283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.37 
 
 		 1120 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  26.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  24 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2478  BNR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 341 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0183941  normal  0.0107385 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2435  BNR repeat-containing protein  21.14 
 
 		 338 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.724955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>