25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2670 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  99.23 
 
 		 388 aa  790    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 388 aa  795    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  99.23 
 
 		 388 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2561  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.99 
 
 		 383 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2688  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  58.25 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  48.45 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  48.45 
 
 		 455 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.32 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.32 
 
 		 449 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.32 
 
 		 449 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.85 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  33.96 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 742 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  38.89 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3230  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.69 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.448997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  29.2 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1940  BNR repeat-containing protein  40 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.242255  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0944  hypothetical protein  29.35 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2533  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1043 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1783  BNR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0329524  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1678  BNR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 336 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  0.180589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2595  BNR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 336 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  32.93 
 
 		 343 aa  43.1  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2018  BNR domain-containing protein  35.94 
 
 		 319 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>