18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2561 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2561  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 383 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2688  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  99.48 
 
 		 396 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.99 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.73 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.73 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  46.89 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.45 
 
 		 449 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  46.63 
 
 		 455 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  39.22 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  37.74 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.22 
 
 		 897 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  35.19 
 
 		 369 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1349  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.86783e-22  decreased coverage  0.0000013848 
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  31.43 
 
 		 340 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1495  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.23 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.769318  normal  0.51143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>