15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2688 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2688  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  100 
 
 		 396 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2561  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  99.48 
 
 		 383 aa  782    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2030  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.99 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0965849  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2641  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  57.99 
 
 		 388 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2670  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  58.25 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2671  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.37 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2642  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.37 
 
 		 449 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2031  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  48.37 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0188279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2562  hypothetical protein  46.56 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2689  hypothetical protein  46.89 
 
 		 455 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2936  hypothetical protein  37.25 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.608835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3143  BNR domain-containing protein  37.74 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.980109 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  25.22 
 
 		 897 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1495  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.23 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.769318  normal  0.51143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1550  hypothetical protein  34.85 
 
 		 342 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>